ΠΕΡΙΓΡΑΜΜΑ ΜΑΘΗΜΑΤΟΣ

ΕΦΑΡΜΟΓΕΣ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΚΗΣ ΣΤΙΣ ΒΙΟΪΑΤΡΙΚΕΣ ΕΠΙΣΤΗΜΕΣ

1. ΓΕΝΙΚΑ

ΣΧΟΛΗ School of Health Sciences
ΤΜΗΜΑ Department of Biomedical Sciences
ΕΠΙΠΕΔΟ ΣΠΟΥΔΩΝ Undergraduate
ΚΩΔΙΚΟΣ ΜΑΘΗΜΑΤΟΣ 285-190302 ΕΞΑΜΗΝΟ ΣΠΟΥΔΩΝ 3rd
ΤΙΤΛΟΣ ΜΑΘΗΜΑΤΟΣ ΕΦΑΡΜΟΓΕΣ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΚΗΣ ΣΤΙΣ ΒΙΟΪΑΤΡΙΚΕΣ ΕΠΙΣΤΗΜΕΣ
ΑΥΤΟΤΕΛΕΙΣ ΔΙΔΑΚΤΙΚΕΣ ΔΡΑΣΤΗΡΙΟΤΗΤΕΣ
σε περίπτωση που οι πιστωτικές μονάδες απονέμονται σε διακριτά μέρη του μαθήματος π.χ. Διαλέξεις, Εργαστηριακές Ασκήσεις κ.λπ. Αν οι πιστωτικές μονάδες απονέμονται ενιαία για το σύνολο του μαθήματος αναγράψτε τις εβδομαδιαίες ώρες διδασκαλίας και το σύνολο των πιστωτικών μονάδων.
ΕΒΔΟΜΑΔΙΑΙΕΣ ΩΡΕΣ ΔΙΔΑΣΚΑΛΙΑΣ ΠΙΣΤΩΤΙΚΕΣ ΜΟΝΑΔΕΣ
Διαλέξεις 4 4
Προσθέστε σειρές αν χρειαστεί. Η οργάνωση διδασκαλίας και οι διδακτικές μέθοδοι που χρησιμοποιούνται περιγράφονται αναλυτικά στο 4.    
ΤΥΠΟΣ ΜΑΘΗΜΑΤΟΣ
Γενικής Υποδομής (ΓΥ),Ειδικής Υποδομής (ΕΥ), Γενικών Γνώσεων (ΓΓΔ) και Επιστημονικής Περιοχής (ΔΔΤΝ, ΕΔ, ΕΥΣ, ΗΛ, ΠΑ) .
 General Background
ΠΡΟΑΠΑΙΤΟΥΜΕΝΑ ΜΑΘΗΜΑΤΑ:  
ΓΛΩΣΣΑ ΔΙΔΑΣΚΑΛΙΑΣ και ΕΞΕΤΑΣΕΩΝ:  Ελληνικά
ΤΟ ΜΑΘΗΜΑ ΠΡΟΣΦΕΡΕΤΑΙ ΣΕ ΦΟΙΤΗΤΕΣ ERASMUS Ναι
ΗΛΕΚΤΡΟΝΙΚΗ ΣΕΛΙΔΑ ΜΑΘΗΜΑΤΟΣ (URL) https://moodle.teithe.gr/course/view.php?id=4669

2. ΜΑΘΗΣΙΑΚΑ ΑΠΟΤΕΛΕΣΜΑΤΑ

Μαθησιακά Αποτελέσματα
Περιγράφονται τα μαθησιακά αποτελέσματα του μαθήματος οι συγκεκριμένες  γνώσεις, δεξιότητες και ικανότητες καταλλήλου επιπέδου που θα αποκτήσουν οι φοιτητές μετά την επιτυχή ολοκλήρωση του μαθήματος.

Σκοπός του μαθήματος είναι να εισάγει τον φοιτητή στις βασικές έννοιες …

Με την επιτυχή ολοκλήρωση του μαθήματος ο φοιτητής/τρια θα είναι σε θέση:

  • Να αναλύει την…
  • Να περιγράφει τις…
  • Να κατανοεί το…
  • Να συγκρίνει τα…
Γενικές Ικανότητες
Λαμβάνοντας υπόψη τις γενικές ικανότητες που πρέπει να έχει αποκτήσει ο πτυχιούχος (όπως αυτές αναγράφονται στο Παράρτημα Διπλώματος και παρατίθενται ακολούθως) σε ποια / ποιες από αυτές αποσκοπεί το μάθημα;.
Αναζήτηση, ανάλυση και σύνθεση δεδομένων και πληροφοριών με τη χρήση και των απαραίτητων τεχνολογιών - Προσαρμογή σε νέες καταστάσεις - Λήψη αποφάσεων - Αυτόνομη εργασία - Ομαδική εργασία - Εργασία σε διεθνές περιβάλλον - Εργασία σε διεπιστημονικό περιβάλλον - Παράγωγή νέων ερευνητικών ιδεών Σχεδιασμός και διαχείριση έργων - Σεβασμός στη διαφορετικότητα και στην πολυπολιτισμικότητα - Σεβασμός στο φυσικό περιβάλλον - Επίδειξη κοινωνικής, επαγγελματικής και ηθικής υπευθυνότητας και ευαισθησίας σε θέματα φύλου - Άσκηση κριτικής και αυτοκριτικής - Προαγωγή της ελεύθερης, δημιουργικής και επαγωγικής σκέψης

Με το πέρας του μαθήματος ο φοιτητής θα:

Γνώσεις

Γνωρίζει διαθέιμες βάσεις δεδομένων δομής πρωτεϊνών και νουκλεϊνικών οξέων και εργαλεία αξιοποίησής τους. Βάσεις δεδομένων βιολογικής δράσης μορίων και δυνατότητες αξιοποίησής τους. Διαδυκτιακά προγράμματα πρόβλεψης αλληλεπίδρασης βιομορίων κλπ.

Επίσης, με το πέρας του μαθήματος ο φοιτητής θα:

έχει αποκομίσει μια ευρεία εικόνα σχετικά με την επίδραση των νέων τεχνολογιών στον τομέα της υγείας γνωρίζει πολλές από τις εφαρμογές και τις λύσεις που προσφέρονται

είναι σε θέση να αναγνωρίζει τους βασικότερους τεχνολογικούς όρους στην υγεία

αντιλαμβάνεται την προσφορά των νέων τεχνολογιών στη βελτίωση της παροχής υπηρεσιών υγείας

 

Δεξιότητες

Ειδικότερα για μια πρωτεΐνη θα μπορεί :

α) Nα βρει την αμινοξική ακολουθία χρησιμοποιώντας την PubMedprotein ή την Uniprot

β) Να βρει την τριτοταγή διαμόρφωση ( 3D δομής) της πρωτεΐνης μέσω της PubMedstructure

γ) Να συγκρίνει την αμινοξική ακολουθία της πρωτεΐνης με την αμινοξική ακολουθία άλλων πρωτεϊνών μέσω του BLASTp (NCBI) ή του Uniprot BLAST (SIB)

δ) Να συγκρίνει την τρισδιάστατης δομής της πρωτεΐνης με την τρισδιάστατη δομή μιας άλλης πρωτεΐνης μέσω του RCSB proteinalignmenttool.

ε) Να βρεί για αυτή την πρωτεΐνη την αλληλουχία νουκλεοτιδίων του γονιδίου / mRNA.

Στ) Να συγκρίνει την αλληλουχία DNA με άλλες αλληλουχίες (π.χ. BLAST) για να βρεί αλληλουχίες που εμφανίζουν ομοιότητα.

ζ) Να αξιοποιεί την βάση PubMedgene (NCBI)

για να βρει:

Συνώνυμα της πρωτεΐνης αν υπάρχουν

Σε ποιο χρωμόσωμα βρίσκεται το γονίδιο (genomiccontext)

Σε ποιους ιστούς εκφράζεται; (expression)

Τρείς αναφορές στην λειτουργικότητα της πρωτεΐνης (GeneReferencesintoFunctions)

Τρία βιομόρια με τα οποία αλληλεπιδρά  (Interactions)

Στοιχεία για την υποκυτταρική κατανομή του μορίου (localization / component)

Μία πάθηση με την οποία σχετίζεται (αν υπάρχει) (Human ProteinRefferenceDataBase/Diseases)

η) Να αναζητά στοιχεία γλυκοσυλύωσης μέσω των βάσεων Uniprot και τις συνδεδεμένες βάσεις Glyconnect κλπ.

θ)Επίσης ο φοιτητής θα μπορεί να βρει πληροφορίες για ένα ένζυμο χρησιμοποιώντας την εφαρμογή ΕΝΖΥΜΕ της ExPASy και τις βάσεις BRENDA και PROSITE.

Χρησιμοποιώντας την BRENDA θα μπορεί να απαντήσει τα ερωτήματα:

–    Ποιος είναι ο κωδικός EC του ενζύμου

–  Με ποια ονόματα ή συντομογραφίες είναι γνωστό; (SΥNONYMS)

–  Ποια αντίδραση/εις καταλύει; (REACTION)

–   Να βρεί τα μεταβολικά μονοπάτια στα οποία συμμετέχει (PATHWAYS)

–  Να βρει τα υποστρώματα του ενζύμου

–  Να βρει τους οργανισμούς στους οποίους έχει αναφερθεί η ύπαρξή του ενζύμου

–   το συνένζυμο που χρησιμοποιεί αν υπάρχει

–   Αν ενεργοποιείται από μεταλλικά ιόντακαιποιά

–   Τους αναστολείς και ενεργοποιητές του ενζύμου αν υπάρχουν

–  Ασθένειες που συνδέονται με το ένζυμο

– Την Km του ενζύμου για κάθε υπόστρωμα και το βέλτιστο pH δράσης

– Την αντοχή στη θερμοκρασία

-Τους ιστούς στους οποίους ανιχνεύτηκε το ένζυμο

–    την υποκυτταρική κατανομή του ενζύμου

– Τις εφαρμογές του ενζύμου.

 

Οι φοιτητές μαθαίνουν να χρησιμοποιούν εργαλεία πρόβλεψης για να κάνουν:

ι) Πρόβλεψη θέσεων γλυκοσυλύωσης και δομής γλυκοσυλυωμένης πρωτεΐνης μέσω των online Προγραμμάτων ΝetNGlyc 1.0, GlyProt κλπ.

κ) Πρόβλεψη αλληλεπίδρασης πρωτεϊνών

λ) Πρόβλεψη τρισδιάστατης δομής από την αμινοξική ακολουθία μέσω του PredictProtein Swiss Model.

μ) Πρόβλεψη βιολογικής δράσης ένωσης με online προγράμματα σύγκρισης δομής με τη δομή μορίων γνωστής βιολογικής δράσης π.χ. PASS

ν) Πρόβλεψη βιολογικής δράσης π.χ. αναστολής ενζύμου με χρήση προγραμμάτων πρόβλεψης δημιουργίας σταθερού συμπλόκου (Docking).

ξ) Πρόβλεψη οξείας τοξικότητας και οικοτοξικότητας με online προγράμματα σύγκρισης δομής με τη δομή μορίων γνωστής τοξικότητας όπως το PASS-GUSAR.

 

Ικανότητες

Ο φοιτητής στο τέλος του μαθήματος θα πρέπει να κατανοεί πως οι διάφορες διαθέσιμες βάσεις δεδομένων και εργαλεία μπορούν να αξιοποιηθούν για την απάντηση ερωτημάτων στον Τομέα της Βιοϊατρικής.

Επίσης ο φοιτητής στο τέλος του μαθήματος θα πρέπει να κατανοεί πώς οι τεχνολογικές εξελίξεις μπορούν να βοηθήσουν τους εργαζόμενους του χώρου

αναγνωρίζει τα οφέλη από την «εκμετάλλευση» της πληροφορικής και των τηλεπικοινωνιών στο χώρο της υγείας

κατανοεί τα προβλήματα που καλείται να αντιμετωπίσει σε επίπεδο χρηστών

κατανοεί τα προβλήματα που καλείται να αντιμετωπίσει ο επιστήμονας πληροφορικής που σχεδιάζει ένα σύστημα ιατρικής πληροφορικής

θα είναι οικείος και ενήμερος για τις τελευταίες εξελίξεις στον τομέα της ιατρικής πληροφορικής

θα μπορεί να συμμετέχει ενεργά στην ευρύτερη ομάδα υποστήριξης θεμάτων ιατρικής πληροφορικής

θα έχει αποκομίσει μια ολοκληρωμένη εικόνα των θεμάτων που άπτονται στο αντικείμενο της ιατρικής πληροφορικής και της γενικότερης ηλεκτρονικής υγείας

θα είναι ενήμερος για την παρούσα κατάσταση σε παγκόσμιο επίπεδο και τις εξελίξεις που διαδραματίζονται στα θέματα της ιατρικής πληροφορικής.

θα γνωρίζει που οδηγούνται οι έρευνες και τι αναμένεται στο εγγύς μέλλον σε σχέση με τον τομέα της υγείας και τις νέες τεχνολογίες τόσο σε επίπεδο ασθενή όσο και σε επίπεδο επαγγελματία υγείας.

Τέλος θα μάθει να αξιοποιεί βασικές εφαρμογές των windows για την αντιμετώπιση βασικών αναγκών παρουσίασης και επεξεργασίας δεδομένων.

3. ΠΕΡΙΕΧΟΜΕΝΟ ΜΑΘΗΜΑΤΟΣ

Sorry, this entry is only available in Ελληνικά.

4. ΔΙΔΑΚΤΙΚΕΣ και ΜΑΘΗΣΙΑΚΕΣ ΜΕΘΟΔΟΙ - ΑΞΙΟΛΟΓΗΣΗ

ΤΡΟΠΟΣ ΠΑΡΑΔΟΣΗΣ
Πρόσωπο με πρόσωπο, Εξ αποστάσεως εκπαίδευση κ.λπ.
Στην αίθουσα διδασκαλίας πρόσωπο με πρόσωπο και κατά περίπτωση με σύγχρονη διαδικτυακή εκπαίδευση (zoom).
ΧΡΗΣΗ ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΩΝ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΑΣ ΚΑΙ ΕΠΙΚΟΙΝΩΝΙΩΝ
Χρήση Τ.Π.Ε. στη Διδασκαλία, στην Εργαστηριακή Εκπαίδευση, στην Επικοινωνία με τους φοιτητές

Χρήση Τ.Π.Ε. στη διδασκαλία και χρήση του ηλεκτρονικού ταχυδρομείου και της πλατφόρμας ασύγχρονης εκπαίδευσης για την επικοινωνία και ενημέρωση των φοιτητών αντίστοιχα. Χρήση του e-class (moodle) για την ανάρτηση και διακίνηση οδηγιών, διαλέξεων, χρήσιμων συνδέσμων (links), ερωτηματολογίων και λοιπών πληροφοριών σχετικών με το μάθημα, την ανάθεση και κατάθεση εργασιών κλπ.

Χρήση online βάσεων δεδομένων και προγραμμάτων επεξεργασίας δεδομένων από τους φοιτητές κατά την προετοιμασία των εργασιών που ανατίθενται

ΟΡΓΑΝΩΣΗ ΔΙΔΑΣΚΑΛΙΑΣ
Περιγράφονται αναλυτικά ο τρόπος και μέθοδοι διδασκαλίας. Διαλέξεις, Σεμινάρια, Εργαστηριακή Άσκηση, Άσκηση Πεδίου, Μελέτη & ανάλυση βιβλιογραφίας, Φροντιστήριο, Πρακτική (Τοποθέτηση), Κλινική Άσκηση, Καλλιτεχνικό Εργαστήριο, Διαδραστική διδασκαλία, Εκπαιδευτικές επισκέψεις, Εκπόνηση μελέτης (project), Συγγραφή εργασίας / εργασιών, Καλλιτεχνική δημιουργία, κ.λπ. Αναγράφονται οι ώρες μελέτης του φοιτητή για κάθε μαθησιακή δραστηριότητα καθώς και οι ώρες μη καθοδηγούμενης μελέτης ώστε ο συνολικός φόρτος εργασίας σε επίπεδο εξαμήνου να αντιστοιχεί στα standards του ECTS

Teaching Organization

ActivitySemester workload
Διαλέξεις-Εισηγήσεις με τη χρήση οπτικοακουστικών μέσων. Αναθέσεις/Παρουσιάσεις Εργασιών από φοιτητές.120
Total120
ΑΞΙΟΛΟΓΗΣΗ ΦΟΙΤΗΤΩΝ
Περιγραφή της διαδικασίας αξιολόγησης Γλώσσα Αξιολόγησης, Μέθοδοι αξιολόγησης, Διαμορφωτική ή Συμπερασματική, Δοκιμασία Πολλαπλής Επιλογής, Ερωτήσεις Σύντομης Απάντησης, Ερωτήσεις Ανάπτυξης Δοκιμίων, Επίλυση Προβλημάτων, Γραπτή Εργασία, Έκθεση / Αναφορά, Προφορική Εξέταση, Δημόσια Παρουσίαση, Εργαστηριακή Εργασία, Κλινική Εξέταση Ασθενούς, Καλλιτεχνική Ερμηνεία, Άλλη / Άλλες. Αναφέρονται ρητά προσδιορισμένα κριτήρια αξιολόγησης και εάν και που είναι προσβάσιμα από τους φοιτητές.

Γραπτή τελική εξέταση που περιλαμβάνει:

  • Ερωτήσεις  Ανάπτυξης
  • Δοκιμασία Πολλαπλής Επιλογής
  • Ερωτήσεις Σύντομης Απάντησης
  • Εργασίες-Παρουσιάσεις

5. ΣΥΝΙΣΤΩΜΕΝΗ ΒΙΒΛΙΟΓΡΑΦΙΑ

Συγγράμματα

  1. 1. Παντελεήμωνος Μπάγκου, «Βιοπληροφορική». Ελληνικά Ακαδημαϊκά Ηλεκτρονικά Συγγράμματα και Βοηθήματα – Αποθετήριο “Κάλλιπος”, ISBN: 978-960-603-329-2 Κωδικός Βιβλίου στον Εύδοξο: 59303485, Έκδοση: 1/2016′
  2. Δημήτρη Γ. Καπόπουλου, «Η συμβολή της πληροφορικής στην Υγεία», Εκδόσεις Δίαυλος Α.Ε., Έκδοση 2η/2016, ISBN: 978-960-531-358-6) Κωδικός Εύδοξου: 59365773
  3. Ι. Κουμπούρος, “Τεχνολογίες Πληροφοριών και Επικοινωνίας & Κοινωνία”, Εκδόσεις Νέων Τεχνολογιών, 1η έκδοση, 2012, ISBN:978-960-6759-73-4
  4. « Πληροφορική στην Υγεία». Κωδικός Εύδοξου: 68384768
  5. Ball M. and Gold J., (2006). Banking on Health: Personal Records and Information Exchange, Journal of Healthcare Information Management, Vol.20 (2), pp.71-83.
  6. Bates D.W. and Gawande A.A., Improving Safety with Information Technology, New England Journal of Medicine, 348, June 19, 2003, pp.2526–34.